Die unten aufgeführten Forschungsprojekte wurden von der Stiftung MGU vor der 2005 erfolgten Universitätseingliederung abgeschlossen. Sie widmeten sich dem Beziehungsgeflecht von Mensch, Gesellschaft und Umwelt unter den Gesichtspunkten einer nachhaltigen Entwicklung. In diesem Sinne betrieb die Stiftung MGU bereits damals interdisziplinäre, partizipative Forschung, bei der die Umsetzung der Resultate integral zum Forschungsprozess gehört.

Die MGU Forschungsbroschüre aus dem Jahr 2000 bietet einen Überblick über das Programm und gibt Rechenschaft über die Forschungsperioden 1994-96, 1997-99 und 2000-2002.